一次性使用肛肠吻合器及附件的生产许可证办理涉及医疗器械的生产管理制度。具体步骤如下：

准备申请资料：需要准备企业基本情况介绍、生产设备的清单和性能说明、生产场地的平面图和照片、产品的技术要求、生产工艺流程图和质量标准等文件、产品的检验报告和临床试验报告等。

提交申请：向所在地省级或国家药品监督管理部门提交医疗器械生产许可申请。

主管部门审核：药品监督管理部门会对申请资料进行审核，包括生产条件、技术要求、质量管理体系等方面。

现场核查：药品监督管理部门会对企业进行现场核查，核实企业的生产和质量管理体系是否符合要求，并对企业的生产和检验设备进行检验。

审批与发证：如果申请资料和现场核查都符合要求，药品监督管理部门会颁发医疗器械生产许可证。

许可证管理：企业需要妥善保管生产许可证，并按照监管机构的要求进行年度报告、质量管理体系审核等后续工作。