呼吸道感染检测仪器生产许可证的办理是一个复杂且严谨的过程，需要企业按照相关法规和标准进行申请和审核。以下是一般性的办理步骤，供您参考：

了解法规与标准：

深入研究和理解国家关于医疗器械生产许可的法规、规章和标准，特别是针对呼吸道感染检测仪器的具体要求。

注意关注最新法规动态，确保申请流程符合最新要求。

准备申请材料：

企业法人营业执照副本原件及复印件。

医疗器械生产（含Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ类）的备案凭证原件及复印件。

呼吸道感染检测仪器的详细技术资料，包括产品注册证明、技术规格、性能参数等。

质量管理体系文件，如质量手册、程序文件等，证明企业具备完善的质量管理和控制体系。

生产场地的相关文件，如平面图、布局图等，证明生产环境符合相关要求。

企业安全管理制度和质量管理手册等内部管理文件。

人员资质证明，包括生产、质量和技术负责人的身份证明、学历、职称证明等。

其他根据各地药监局具体要求所需的证明资料。

在线申请预审：

登录国家食品药品监督管理局网站或相关监管机构的在线平台。

提交准备好的申请材料，进行在线预审。

预审合格后，获得预审通过的通知，准备进入下一步的现场审核。

现场审核：

国家相关部门安排工作人员对企业进行现场审核。

审核人员将对申请材料所涉及的内容进行核实，包括现场抽样检查、工艺流程检查等。

审核合格后，进入下一步的评估流程。

评估与发证：

经过综合评估，如果企业符合生产许可的要求，监管机构将发放呼吸道感染检测仪器的生产许可证。