肠道病毒通用型核酸检测试剂盒的IVDD（体外诊断试剂指令）办理流程是一个复杂且需严格遵循的过程，尤其是在涉及欧盟市场时。以下是根据当前信息和一般性的指导，归纳出的办理流程：

了解IVDR法规：

尽管IVDD指令（98/79/EC）已经失效，但新的IVDR法规（2017/746）已经取而代之。因此，需要详细了解IVDR法规及其相关的欧盟法规，确保产品符合所有最新要求。

确定产品技术规格和性能：

明确肠道病毒通用型核酸检测试剂盒的技术规格、性能特点、预期用途等信息。这包括检测原理（如PCR-荧光探针法）、灵敏度、特异性等关键指标。

准备技术文档：

编制详细的技术文档，包括产品的技术规格、性能评估报告、临床数据（如果适用）、用户手册、标签、质量控制文件等。确保所有文档内容准确、完整，并符合IVDR法规的要求。

企业资质准备：

准备企业的基本信息，如企业名称、注册地点、联系方式、生产设施等。确保企业具备生产医疗器械的资质，包括相应的生产许可证和认证证书。

根据产品特点和目标市场，选择一个合适的认证机构进行产品认证。这个机构应该具备相应的资质和经验，能够按照IVDR法规的要求对产品进行评估和审核。

将准备好的申请材料提交给认证机构或相关监管机构。在提交申请时，请确保所有材料齐全、准确，并符合IVDR法规的要求。

技术评审：

认证机构将对提交的申请材料进行技术评审，评估产品的安全性、有效性和合规性。评审过程可能包括对产品技术规格、性能评估报告、临床数据等的详细审查。

现场检查（如需要）：

根据需要，认证机构可能会对企业的生产现场进行现场检查，以核实生产条件、质量管理体系等是否符合IVDR法规的要求。

如果产品通过技术评审和现场检查（如需要），认证机构将颁发相应的认证证书。这个证书将证明产品已经通过了欧盟的体外诊断试剂认证，可以在欧盟市场上销售和使用。

获得认证后，企业需要定期更新和维护证书的有效性，包括提交产品更新报告、接受监督检查等。同时，企业需要密切关注法规变化，确保产品持续合规。