在申请医用呼吸机在菲律宾的PFDA（菲律宾食品和药品管理局）认证时，可以考虑以下步骤：

1. 了解PFDA的要求： 在开始之前，仔细研究PFDA对医疗器械认证的要求。这可能包括技术规范、测试标准、质量管理体系等方面的要求。PFDA的网站通常提供相关信息。

2. 选择经验丰富的认证机构： 选择一个经验丰富、资质良好的认证机构。可以查看已经获得PFDA认证的产品，并了解认证机构的声誉和性。

3. 查阅认证机构清单： PFDA可能提供了一份已认证的机构清单，可以在其网站或通过联系PFDA获取。确保选择的认证机构出现在PFDA的认证机构清单中。

4. 了解认证机构的服务范围： 确保选择的认证机构提供医用呼吸机产品的认证服务，并了解其服务范围是否符合的需求。

5. 了解认证流程和时间： 与认证机构沟通，了解认证流程、所需文件和时间线。这有助于做好准备，并确保的申请按时进行。

6. 考虑成本： 考虑认证费用以及与认证相关的其他成本。确保充分了解所有费用，并与认证机构进行明确的沟通。

7. 与其他制造商沟通： 如果可能，与其他制造商或经销商沟通，询问他们选择认证机构的经验和建议。

8. 获取报价和合同： 向选定的认证机构获取详细的报价和认证合同。确保清楚了解所有条款和条件。

9. 与PFDA协调： 在启动认证过程之前，较好与PFDA协调，确保的计划符合其要求，并获得必要的指导。

10. 遵循更新和变更： 保持与认证机构和PFDA的有效沟通，特别是在产品更新或变更时，确保产品始终符合认证要求。

确保选择的认证机构具有经验、性和良好的声誉是非常重要的。