血管内皮功能测试设备的注册证办理需要按照相关法规和程序进行。以下是一般性的办理流程：

准备申请材料：根据医疗器械注册法规的要求，准备相关的申请材料，包括产品技术要求、产品说明书、生产工艺流程图、质量管理体系文件等。

提交申请：将申请材料提交给当地的医疗器械监管部门或相关机构，申请注册证。

审核与评估：监管部门或相关机构会对申请材料进行审核和评估，包括产品的安全性、有效性、质量可控性等方面的评估。

现场检查：监管部门或相关机构会对生产企业进行现场检查，核实产品的生产过程、质量控制等方面的实际情况。

审批与发证：经过审核和评估，如果产品符合注册要求，监管部门或相关机构会颁发注册证。