超导型磁共振成像系统属于第三类医疗器械，需要办理医疗器械注册证等审批手续方可上市销售。具体办理流程如下：

确定企业已取得工商登记，并确定申报产品为第三类医疗器械。

编制完成拟申请产品的医疗器械产品技术要求，并已通过预评价。

准备申请资料，并网上/窗口递交材料。

受理申请。

审查与批准。

制证与发证。

最终，将获得第三类医疗器械注册证或生产许可证。