羟基磷灰石涂层金属骨针的注册证办理流程如下：

提交申请：首先，需要向当地的药品监管部门提交注册申请，并附上必要的技术资料和文件。这些资料应包括产品的制造和质量控制信息、生产设施的详细描述、产品的安全性评估报告等。

技术审评：监管部门将对提交的资料进行技术审评，评估产品的安全性和有效性。在这个阶段，可能需要补充额外的资料或进行临床试验。

现场检查：在技术审评通过后，监管部门将对生产设施进行现场检查，核实产品的制造和质量控制情况。

审批与注册：如果一切顺利，监管部门将授予产品注册证。注册证的有效期通常为几年，并且需要定期更新。

后续监管：获得注册证后，监管部门可能还会对产品进行定期的监管和检查，以确保产品持续符合质量、安全性和有效性的要求。