细菌鉴定及药敏分析系统生产许可证的办理是一个复杂且严格的过程，旨在确保该系统的生产过程符合相关法规和标准，以保障产品的质量和安全。以下是办理生产许可证的一般步骤：

了解法规与标准：深入研究并了解细菌鉴定及药敏分析系统生产相关的法规、规章和指南。这包括了解国家对医疗器械生产的特定规定，以及该系统生产所需遵循的行业标准。

准备申请材料：根据法规要求，准备完整的申请材料。这包括但不限于企业资质证明、生产设施和设备清单、质量管理体系文件、产品技术规格、工艺流程图、质量控制方法等。确保所有材料真实、准确，并符合相关法规的格式和要求。

提交申请：将准备好的申请材料提交给相应的监管机构或认证机构。确保提交过程符合规定，避免遗漏或错误。

现场审核：监管机构或认证机构会对申请企业进行现场审核。这包括对生产设施、设备、工艺流程、质量管理体系等的实地检查和评估。企业需要配合审核工作，确保生产现场符合相关要求。

整改与改进：如果在现场审核中发现不符合项或问题，企业需要根据要求进行整改，并提交相应的改进报告。整改完成后，可能需要再次接受审核。

获得生产许可证：如果审核通过，且企业符合相关法规和标准的要求，监管机构或认证机构将颁发细菌鉴定及药敏分析系统生产许可证。这是企业合法生产该系统的凭证。