流感病毒（甲、乙型）双重核酸检测试剂盒的出口认证办理涉及多个环节和文件准备，以下是一个详细的办理流程：

了解目标市场法规

深入研究目标国家或地区关于体外诊断试剂（IVD）的法规和标准，特别是针对甲、乙型流感病毒核酸检测试剂盒的具体要求。例如，欧盟的IVDR（体外诊断医疗器械法规）、美国的FDA（食品药品监督管理局）规定等。

准备企业资质文件

准备企业法人营业执照、组织机构代码证、医疗器械生产许可证（如适用）、医疗器械经营许可证（如适用）等资质证明。

准备产品技术文件

包括产品说明书、技术规格书、设计图纸、生产工艺流程图、质量控制标准、性能评估报告和安全性评估资料等。这些文件应详细阐述产品的设计、制造、性能、测试等方面的信息，并符合国际或国家标准，如ISO 13485医疗器械质量管理体系标准。

选择认证机构

根据目标市场的法规要求，选择适当的认证机构或监管机构进行申请。例如，在欧盟市场，需要向欧盟委员会指定的认证机构申请CE认证；在美国市场，则需要向FDA提交注册或授权申请。

提交申请材料

填写并提交相关的认证或注册申请表，同时附上前期准备的所有申请材料。确保材料的完整性和准确性，以便认证机构或监管机构进行审核。

接受审核

认证机构或监管机构将对提交的技术文件进行详细的审核，确保其完整性、合规性和准确性。此外，还可能对企业的生产现场、质量管理体系等进行现场审核，或对产品进行抽样检测或评估。

获得认证或注册

如果申请获得批准，认证机构或监管机构将颁发相应的认证证书或注册证，并注明注册编号和有效期限。这些证书是产品进入目标市场的必要条件。

准备报关文件

包括合同、发票、装箱单、申报要素等必要的报关文件。此外，还需要提供符合性声明、中英文MSDS、中英文产品说明书、检测报告、中英文CE证书（如适用）等文件。

办理出口手续

向海关提交报关文件，并办理出口手续。确保产品符合海关的监管要求，并顺利通过海关检验。对于特殊物品，如流感病毒核酸检测试剂盒，可能需要向海关申领出口特殊物品审批单，并提供相关文件和信息。

持续符合法规要求

企业在获得认证或注册后，需要确保持续符合相关法规和标准的要求，包括生产、质量控制、销售等方面。及时更新和维护认证证书或注册证的有效性，如进行产品变更、重新注册等操作。

关注法规变化

医疗器械出口法规可能随时发生变化，出口企业应密切关注相关法规的更新和变化，以确保产品的合规性。