中枢神经特异性蛋白（S100）测定试剂盒的IVDD（In Vitro Diagnostic Devices，体外诊断试剂指令，现已被MDR2017/745即IVDR取代，但在过渡期内仍可能适用IVDD规定）办理是一个复杂且需要遵循严格规定的过程。以下是根据当前行业实践和法规要求，概括性的办理流程及注意事项：

法规研究：深入研究目标市场（如欧盟）关于体外诊断试剂的法规、政策和标准，特别是针对S100测定试剂盒的具体要求。特别注意IVDR的最新动态，但也要了解IVDD的相关规定，因为过渡期内可能仍适用。

产品了解：详细了解S100测定试剂盒的技术特性、适应症、使用方法、储存条件等。确认产品的生产厂商、产地、规格、保质期等基本信息。

技术文件编制：编制详尽的技术文件，包括产品说明书、技术规格、生产工艺流程图、质量控制手册、风险评估报告等。这些文件应充分证明产品的安全性、有效性和符合性，并符合目标市场的具体要求。产品说明书应详细描述产品的性能、用途、使用方法、注意事项等。技术文件还应包括产品的设计原理、生产工艺、质量控制标准等。

临床试验准备：如果法规要求，应准备临床试验数据以验证产品的性能、安全性和有效性。这些数据应详细记录，并符合规定的试验标准。

质量管理体系建立：建立并运行符合ISO13485等标准的质量管理体系，确保产品的生产过程和质量控制符合法规要求。准备质量管理体系文件，以证明产品的生产过程和质量控制符合法规要求。

文件准备与提交：将准备好的技术文件、临床试验数据（如需要）、质量管理体系文件等提交给相应的监管机构或认证机构。提交之前，应仔细检查材料的完整性和准确性，并按照要求填写申请表格。

文件审核：监管机构或认证机构将对提交的材料进行全面审核，包括对产品安全性、有效性、性能等方面的评估。如果发现任何问题或需要补充的信息，将通知申请人进行整改或补充。

现场检查：根据要求，监管机构或认证机构可能会进行现场检查，包括检查生产设施、设备、工艺流程、质量控制体系等。现场检查的目的是确保生产过程和产品质量符合相关法规和标准的要求。

评估与反馈：监管机构或认证机构将对现场检查的结果进行评估，并向申请人提供反馈。如果发现问题或不符合项，申请人需要进行整改并重新提交审核。

如果技术文件审核和现场审核（如需要）均通过，监管机构或认证机构将颁发相应的注册证或认证证书，允许S100测定试剂盒在目标市场上销售和使用。

持续合规：在产品上市后，应持续遵守相关法规和标准，并接受监管机构的监管。如有任何产品变更或新的安全性、有效性数据等，应及时更新并提交给监管机构或认证机构。

定期审核与评估：定期进行质量体系的审核和产品的重新评估，确保产品的质量和安全性。

法规更新：考虑到IVDD或其他相关法规的更新和变更，建议尽早开始办理流程，确保有足够的时间来准备文件和应对可能的审核。

费用评估：办理过程中可能需要支付一定的费用，包括注册机构的服务费、测试费用等，在办理前应对成本进行充分评估。