超导型磁共振成像系统的生产许可证的办理步骤如下：

主管部门：首先，需要确定申请应提交给哪个主管部门，即guojiaji药品监督管理部门。

准备申请资料：这是申请过程中的一个关键步骤，需要准备所有必要的文件和资料，包括技术文件、产品规格、制造工艺、质量控制文件等。

递交申请：准备好申请资料后，可以选择网上或窗口递交。

受理：提交申请后，主管部门会进行受理。

审查与批准：主管部门会对申请进行详细审查，确保所有资料符合要求，并决定是否批准。

制证与发证：如果申请被批准，主管部门会制作相应的许可证并颁发。