血液透析器生产许可证的办理流程如下：

1. 准备申请资料：收集和整理相关的申请文件和资料，包括产品技术要求、生产质量管理文件、工艺流程图、环境影响评估报告等。

2. 选择合适的申请途径：根据企业的特点和产品情况，选择合适的申请途径，如创新医疗器械注册、特殊注册等。

3. 编制注册申请文件：根据相关法规和标准要求，编制完整的注册申请文件，包括产品技术要求、临床试验数据、质量管理体系文件等。

4. 提交申请：将注册申请文件提交给国家或地区的医疗器械监管机构，并支付相应的申请费用。

5. 主管部门审核与审批：监管机构对申请资料进行审核，包括技术审查、质量管理体系评估、临床试验数据审查等。如果需要，监管机构还可能进行现场核查，以核实企业的生产条件和产品质量。

6. 获取生产许可证：如果审核通过，监管机构将颁发生产许可证，允许企业生产血液透析器。许可证的有效期和具体要求可能因国家或地区而异。

7. 后续监管：企业需要接受监管机构的年度报告、质量管理体系审核等后续监管工作，以确保持续符合法规要求。