半自动生化分析仪生产许可证的办理流程如下：

1. 准备申请资料：根据国家相关法规和标准，准备医疗器械生产许可证的申请资料，包括企业基本情况、生产设施和设备情况、质量管理体系情况等。确保资料的完整性和准确性。

2. 提交申请：将申请资料提交给当地食品药品监督管理部门，并缴纳相应的申请费用。

3. 现场核查：当地食品药品监督管理部门将对申请企业的生产条件、设施设备、质量管理体系等方面进行现场核查，以确保企业符合相关法规和标准要求。

4. 审核与批准：审核申请资料和现场核查结果，如果符合要求，将颁发医疗器械生产许可证，允许企业正式生产半自动生化分析仪。