荧光定量PCR仪的IVDD办理涉及一系列步骤，主要目的是确保产品符合欧盟关于体外诊断医疗器械的指令要求，以便在欧盟市场上合法销售和使用。以下是一个大致的办理流程：

1. 了解IVDD指令和要求：

2. 深入研究IVDD指令的内容，了解其对荧光定量PCR仪这类体外诊断医疗器械的具体要求。

3. 特别关注指令中关于产品分类、注册程序、技术文件等方面的规定。

4. 准备技术文件：

5. 根据IVDD指令的要求，准备详细的技术文件，包括产品的技术规格、性能参数、用户手册、标签、使用说明等。

6. 提供关于荧光定量PCR仪的设计、制造、性能验证等方面的信息，确保文件完整、准确并符合指令要求。

7. 确定公告机构（如适用）：

8. 根据荧光定量PCR仪的风险等级和IVDD指令的要求，确定是否需要通过公告机构进行符合性评估。

9. 如果需要，选择合适的公告机构，并按照其要求提交技术文件和申请。

10. 提交注册申请：

11. 将准备好的注册申请材料提交给欧盟的相关监管机构，如欧洲委员会或成员国的主管部门。

12. 确保申请材料的格式、内容和提交方式符合机构的要求。

13. 接受审核与评估：

14. 监管机构将对提交的注册申请材料进行详细审核，包括对技术文件的评估、对产品的技术、安全性、有效性等方面的检查。

15. 根据审核结果，监管机构可能要求补充材料或进行进一步澄清。

16. 获得CE标志和注册证：

17. 如果荧光定量PCR仪通过审核并满足所有要求，监管机构将颁发CE标志和注册证。

18. CE标志是产品符合欧盟指令要求的证明，而注册证则是产品在欧盟市场上合法销售和使用的凭证。