质谱检测仪器IVDD办理主要涉及对体外诊断医疗器械指令（IVDD）的理解和遵循，以及完成一系列申请和审核流程。以下是一般的办理步骤：

1. 了解IVDD指令要求：首先，需要深入研究并理解IVDD指令的具体要求，这包括对质谱检测仪器的管理、安全性和性能等方面的规定。了解指令的清单A、B和其他类别的分类标准，确保对风险等级有清晰的认识。

2. 准备申请材料：根据IVDD指令的要求，准备完整的申请材料。这些材料可能包括产品的技术规格、性能参数、用户手册、标签、使用说明等。同时，需要提供企业的基本信息，如企业名称、注册地点、联系方式等。确保所有材料真实、准确、完整，并按照规定的格式和要求进行整理。

3. 提交申请：将准备好的申请材料提交给相应的欧盟监管机构。在欧盟成员国中，这通常是国家药品监管局或其他相关机构。提交申请时，需要缴纳相应的费用，并遵循所有适用的规定。

4. 审核与评估：监管机构将对申请材料进行审核和评估，以确认质谱检测仪器是否符合IVDD指令的要求。这个过程可能包括对产品的技术、安全性、有效性等方面的评估，以及对企业的质量管理、生产能力等方面的检查。

5. 认证与注册：如果审核通过，监管机构将颁发相应的认证或许可，允许质谱检测仪器在市场上合法销售和使用。这可能涉及公告机构的评估，特别是对于风险较高的器械。