肠道病毒71型和柯萨奇病毒A16型核酸检测试剂盒生产许可证的办理流程通常涉及以下步骤：

1. 了解相关法规和要求：

2. 深入研究并了解目标国家或地区关于医疗器械生产的法规和标准要求，特别是关于核酸检测试剂盒的相关规定。

3. 准备申请材料：

4. 根据目标国家或地区的法规要求，准备完整的申请材料。这些材料可能包括公司基本信息、生产工艺流程、质量控制体系、产品技术规格、设备清单、原材料供应商信息等。

5. 同时，确保准备的临床试验数据、性能测试报告等相关文件符合目标国家或地区的标准和要求。

6. 选择认证机构或监管机构：

7. 根据目标国家或地区的规定，选择合适的认证机构或监管机构进行申请。这些机构通常负责审核和评估申请材料，并决定是否颁发生产许可证。

8. 提交申请：

9. 将准备好的申请材料提交给认证机构或监管机构。在提交申请时，请确保所有材料齐全、准确，并符合相关法规的要求。

10. 接受审核和评估：

11. 认证机构或监管机构将对提交的申请材料进行审核和评估。这可能包括对公司生产设施、质量管理体系、产品技术规格等方面的现场检查或远程审核。

12. 获得生产许可证：

13. 如果审核和评估结果符合要求，认证机构或监管机构将颁发肠道病毒71型和柯萨奇病毒A16型核酸检测试剂盒的生产许可证。

14. 遵守后续监管要求：

15. 在获得生产许可证后，需要遵守目标国家或地区的后续监管要求，如定期报告、接受监督检查、处理不良事件等。