肠道病毒通用型核酸检测试剂盒的注册证办理是一个涉及多个步骤的过程，以下是根据参考文章和相关数字、信息清晰归纳的办理流程：

一、前期准备

1. 了解法规与标准：

2. 深入研究目标国家或地区关于医疗器械和体外诊断试剂（IVD）的注册法规和标准，特别是针对肠道病毒通用型核酸检测试剂盒的具体要求。

3. 准备申请资料：

4. 产品技术文档：包括产品设计、性能、安全性和有效性等详细技术资料。

5. 生产工艺流程图：展示产品的生产流程和质量控制点。

6. 质量管理体系文件：证明企业已建立并运行有效的质量管理体系。

7. 临床试验报告（如适用）：提供与产品相关的临床试验数据和结果。

8. 产品说明书和标签：确保产品的使用说明和标签符合相关法规要求。

二、申请递交

1. 确定申请部门：

2. 根据目标国家或地区的规定，确定将申请递交至当地的药品监管部门或国家药品监督管理局。

3. 递交申请材料：

4. 将准备好的申请材料递交至指定的部门或机构，并缴纳相应的申请费用。

三、技术审核与评估

1. 文件审核：

2. 药品监管部门对提交的申请材料进行初步审核，确保文件的完整性和合规性。

3. 技术评估：

4. 对肠道病毒通用型核酸检测试剂盒的技术性能进行评估，包括其安全性、有效性和质量等方面的测试。

5. 质量管理体系审核：

6. 验证企业的质量管理体系是否符合相关法规和标准的要求。

四、现场核查（如有需要）

五、审批决定

六、领取注册证