肠道病毒71型（EV71）和柯萨奇病毒A16型（Coxsackievirus A16）核酸检测试剂的IVDD（体外诊断试剂指令）办理是一个涉及多个步骤的过程，主要遵循欧盟的相关法规。以下是一般的办理流程：

在开始办理之前，需要详细了解IVDD指令（98/79/EC）及其相关的欧盟法规，确保产品符合所有法规要求。IVDD指令是欧盟针对体外诊断医疗器械制定的法规，旨在确保这些产品的安全性、有效性和质量。

明确核酸检测试剂盒的技术规格、性能特点、预期用途等信息，并准备相应的技术文档。这些文档应详细描述产品的检测原理、灵敏度、特异性、稳定性等关键性能指标，以及产品的使用方法和限制条件。

根据IVDD指令的要求，准备全面的申请材料。这些材料可能包括：

选择一个具备相应资质和经验的认证机构进行产品认证。这个机构应该能够对产品进行全面的评估和审核，确保其符合IVDD指令的要求。

将准备好的申请材料提交给认证机构。在提交申请时，请确保所有材料齐全、准确，并符合相关法规的要求。认证机构将对这些材料进行初步审查，以确定是否需要进行进一步的评估。

认证机构将对申请材料进行技术评审，评估产品的安全性、有效性及合规性。根据需要，认证机构还可能会进行现场检查，以核实生产条件、质量管理体系等是否符合要求。

如果产品符合IVDD指令的要求，认证机构将出具相应的认证证书。这个证书将证明产品已经通过了欧盟的体外诊断试剂认证，可以在欧盟市场上销售和使用。