办理软式内镜清洗消毒器出口认证的过程通常涉及以下几个主要步骤：

1. 了解目标国家的法规和标准：在开始办理出口认证之前，首先要了解目标国家对于医疗器械，特别是软式内镜清洗消毒器的相关法规和标准。这些法规和标准可能包括产品的安全性、有效性、质量标准、环保要求等。

2. 收集和整理相关资料：这包括产品的技术资料、生产工艺、质量标准、检测报告等。所有这些资料都应该按照目标国家的法规和标准进行准备和整理。

3. 进行产品检测：将软式内镜清洗消毒器样品送至相关的检测机构进行检测。这是为了确保产品的安全性和有效性符合目标国家的法规和标准要求。检测报告是出口认证过程中的重要文件。

4. 准备申请文件：根据目标国家的法规和标准要求，准备申请文件。这些文件可能包括产品技术资料、质量管理体系文件、临床试验数据等。所有的文件都应该按照目标国家的法规和标准进行准备。

5. 向目标国家的认证机构提交申请：将准备好的申请文件提交给目标国家的认证机构或相关机构。在提交申请之前，可能需要支付一定的申请费用。

6. 等待审核和现场检查：目标国家的认证机构会对申请文件进行审核，并可能进行现场检查，以核实产品的生产条件和质量管理体系是否符合要求。在这个过程中，可能需要与认证机构进行沟通和协调。

7. 获得出口认证：如果审核和现场检查都通过，那么就可以获得目标国家的出口认证。这通常是一个证书或标志，表明产品已经符合目标国家的法规和标准要求，可以在该国进行销售和使用。